Имамам мечети, прошедшим обучение и аттестацию комиссии в муфтияте, выплачивается благотворительная стипендия из фонда развития духовной культуры «Ыйман».

Основную базу финансовых средств организации составил грант от Турецкой Республики. Помощь осуществляется через Турецкое агентство по сотрудничеству и развитию (TIKA). Также привлекаются средства отечественных и иностранных партнеров с соблюдением принципов открытости и прозрачности. За этим следят наблюдательный совет и правление. Вся отчетность по налогам и социальным выплатам соответствует требованиям законодательства.